Los puntos críticos de atropello de fauna silvestre se utilizan con frecuencia para identificar lugares prioritarios en los que aplicar medidas de mitigación. Sin embargo, es difícil comprender el contexto paisajístico y la dinámica espacial y temporal de estos puntos críticos. Aquí investigamos los factores que impulsan la variación espacio-temporal de los puntos críticos de mortalidad de murciélagos en carreteras a lo largo de tres años. Nuestra hipótesis es que los puntos calientes se localizan donde la actividad de los murciélagos es mayor y que esta actividad está relacionada con la densidad y productividad de la vegetación, probablemente porque está asociada a la disponibilidad de alimento. Se identificaron grupos estadísticamente significativos de colisiones murciélago-vehículo para cada año utilizando el enfoque de Estimación de Densidad de Kernel (KDE). Además, utilizamos un análisis espacio-temporal y modelos lineales mixtos generalizados para evaluar el efecto de la variación espacio-temporal local de los índices ambientales y la actividad de los murciélagos para predecir la variación en la localización de los puntos calientes de atropellos y evaluar la fuerza de los puntos calientes a lo largo del tiempo. Entre 2009 y 2011 realizamos encuestas diarias de murciélagos muertos a lo largo de un transecto de 51 km de longitud que incorpora diferentes tipos de carreteras en el sur de Portugal. Encontramos 509 víctimas e identificamos 86 puntos calientes estadísticamente significativos, que comprendían el 12% de la longitud de la red de carreteras y contenían el 61% de las víctimas. Los puntos calientes tendían a estar localizados en áreas con mayor acumulación de productividad de la vegetación a lo largo del periodo de tres años, alta actividad de murciélagos y baja temperatura. Además, encontramos que sólo el 17% de la longitud de la red de carreteras se clasificó consistentemente como puntos calientes a lo largo de todos los años; mientras que el 43% de los puntos calientes desaparecieron en años consecutivos y el 40% de los nuevos segmentos de carretera se clasificaron como puntos calientes. Así pues, los puntos críticos no persistentes fueron la categoría más frecuente. Los cambios espacio-temporales en la localización de los puntos críticos están asociados a la disminución de la producción de vegetación y al aumento del estrés hídrico en los alrededores de las carreteras. Esto apoya nuestra hipótesis de que la disminución de la productividad global de la vegetación y el aumento del déficit hídrico en los bordes de las carreteras, así como la presumible menor abundancia de presas, tienen un efecto significativo en la disminución de murciélagos atropellados. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que demuestra que los datos de teledetección de libre acceso pueden ser una poderosa herramienta para cuantificar el riesgo de atropello de murciélagos y evaluar su dinámica espacio-temporal.