En este estudio, aplicamos un indicador basado en peces para evaluar la calidad ecológica de aguas someras bajo diferentes escenarios de estrés ambiental mediado por eutrofización; (desde los períodos de referencia preeutróficos hasta los períodos eutróficos críticos), así como explorar el papel del confinamiento (es decir, el tiempo de renovación del agua) y la presión antropogénica de la costa como factores que modulan la respuesta del indicador. A pesar de la gran magnitud del impacto de la eutrofización en la laguna, la calidad ecológica de la laguna Las aguas disminuyeron solo ligeramente después de los eventos de mortalidad masiva. El nivel de confinamiento también tuvo ligeros efectos en la calidad ecológica de las áreas poco profundas más confinadas en el verano durante los períodos eutróficos. Por lo tanto, las aguas poco profundas podrían desempeñar un papel fundamental como hábitats de refugio, tanto para los conjuntos de peces como para otros taxones acuáticos, al amortiguar condiciones euxínicas durante los procesos de eutrofización". De hecho, las aguas poco profundas podrían actuar como hábitats críticos, permitiendo la recolonización de la biota acuática de las zonas más impactadas de la laguna. Este atributo refuerza la necesidad de gestionar y proteger adecuadamente las zonas costeras de las aguas de transición, escenarios de eutrofización.