El objetivo general del programa es la detección y caracterización de episodios de eutrofización en el Mar Menor y su evolución, en la columna de agua. De acuerdo con esto, los objetivos específicos del programa MMEM son los siguientes: a) Puesta en marcha de un programa de muestreo de la columna de agua con periodicidad mensual. b) Caracterización físico-química del agua. c) Caracterización de la comunidad fitoplantónica. d) Caracterización de la comunidad zooplanctónica (incluyendo medusas). e) Diagnóstico sobre el proceso de eutrofización y su evolución temporal.